ドラフト会議が終了し、計123人が指名された。
今年の指名漏れとなった有名球児を挙げれば箱山 遥人捕手（健大高崎）だろう。センバツ優勝に貢献し、高校通算35本塁打を記録し、実績では高校生NO.1捕手ともいえる選手だった。夏の甲子園ベスト4入りしたスラッガー・正林 輝大外野手（神村学園）も指名漏れ。選抜ベスト4で強肩遊撃手・颯佐 心汰内野手（中央学院）、神奈川大会決勝でサイクルヒットを記録した椎木 卿五捕手（横浜）、夏の甲子園ベスト8入りの俊足打者・藤原 佑外野手（大社）と超高校級の野手たちが指名漏れとなった。
甲子園4度の出場、高校日本代表にも入った高尾 響投手（広陵）、186センチの大型右腕・沼井 伶穏投手（横浜隼人）、140キロ後半の速球を投げ込む平 悠真投手（高知）も注目度が高かったが、指名漏れとなった。
【主な指名漏れ選手一覧】
山内 悠生投手（北見柏陽）
池田 悠真投手（紋別）
岡本 琉奨投手（八戸学院光星）
関 景介投手（太田西山）
箱山 遥人捕手（健大高崎）
小川 哲平投手（作新学院）
昆野 太晴投手（白鷗大足利）
中村 星哉内野手（宇都宮短大附）
三井 雄心内野手（浦和学院）
颯佐 心汰内野手（中央学院）
椎木 卿五捕手（横浜）
沼井 伶穏投手（横浜隼人）
内山 京介投手（豊橋中央）
森 厳徳投手（県岐阜商）
志水 那優捕手（大阪学院大高）
高尾 響投手（広陵）
藤原 佑外野手（大社）
金田 龍乃介投手（中津東）
正林 輝大外野手（神村学園）
坂口 優志内野手（樟南）
