ドラフト会議が終了し、123名が指名された。指名漏れとなった大学生では慶応大のスラッガー・清原 正吾内野手(慶応)が指名漏れ。今秋は2本塁打を放ったが、指名漏れだった。富士大のスラッガー・佐々木 大輔内野手(一関学院)、大学日本代表にも選出された立正大・飯山 志夢外野手(中央学院)、大阪経済大・林 翔大投手(乙訓)、柴﨑 聖人外野手(岐阜第一)とこのドラフト1年でアピールに成功した選手たちも指名漏れに終わった。

【主な指名漏れの大学生一覧】
富士大・佐々木 大輔一関学院
東北福祉大・小林 禅投手(佐久長聖
慶応大・清原 正吾内野手(慶応
慶応大・水鳥 遥貴内野手(慶応
早稲田大・鹿田 泰生(早稲田実
早稲田大・印出 太一中京大中京
法政大・吉鶴 翔瑛投手(木更津総合
法政大・中津 大和内野手(小松大谷
國學院大・柳舘 憲吾内野手(日大三
中央大・櫻井 亨佑内野手(習志野
立正大・飯山 志夢外野手(中央学院
日本体育大・箱山 優投手(日体大柏
桐蔭横浜大・加田 拓哉外野手(帝京
立命館大・竹内 翔汰外野手(創志学園
大阪経済大・林 翔大投手(乙訓
大阪経済大・柴﨑 聖人外野手(岐阜第一
九州共立大・笹原 愛斗捕手(真颯館